输卵管造影是一种侵入性的手术操作，在扩张阴道、阴道宫颈消毒、插管时都有轻到中度的不适感，甚至出现轻度疼痛感，一般来说这些都是可以忍受的。

有的女士由于对检查过程的未知，精神极度紧张，不能够很好地配合体位，紧绷肌肉，反而造成更多的不适感或疼痛。

有的则因为子宫位置屈曲、宫颈角度不佳或宫颈管狭长等因素，在造影的过程中可能需要使用手术钳牵拉宫颈或扩张宫颈，都使不适或疼痛感加重。

这些不适多为心理因素，与输卵管不通无关，非“不通则痛”之故。痛不痛，并不能反映造影的结果。

输卵管造影具有一定的个体差异性。有的女性因为子宫位置“不正”、宫颈暴露困难、宫颈管狭窄等因素，会导致置管困难，明显增加造影检查所需时间；有的女性宫颈口较为松弛，造影管球囊反复滑脱需要重新置管，也会增加耗时。
此外，输卵管造影的结果有一定的“假阳性”几率，就是说有的女士输卵管其实是通畅的，但是由于输卵管痉挛、内膜小栓子或气泡堵塞，在造影时输卵管不显影，被误认为“梗阻”。

为了减少“假阳性”结果的发生，医生需要调整置管位置，改变体位、加大造影剂注射量等，反复操作就延长检查时间。